Minn mindu ġiet skoperta f'Djibouti fl-2012, in-nemusa Asjatika Anopheles stephensi nfirxet madwar il-Qarn tal-Afrika. Dan il-vettur invażiv qed ikompli jinfirex madwar il-kontinent, u joħloq theddida serja għall-programmi ta' kontroll tal-malarja. Metodi ta' kontroll tal-vettur, inklużi xbieki tas-sodda ttrattati bl-insettiċidi u bexx residwu ġewwa, naqqsu b'mod sinifikanti l-piż tal-malarja. Madankollu, il-prevalenza dejjem tiżdied ta' nemus reżistenti għall-insettiċidi, inklużi l-popolazzjonijiet ta' Anopheles stephensi, qed tfixkel l-isforzi kontinwi għall-eliminazzjoni tal-malarja. Il-fehim tal-istruttura tal-popolazzjoni, il-fluss tal-ġeni bejn il-popolazzjonijiet, u d-distribuzzjoni tal-mutazzjonijiet ta' reżistenza għall-insettiċidi huwa essenzjali biex jiġu ggwidati strateġiji effettivi ta' kontroll tal-malarja.
It-titjib tal-fehim tagħna ta' kif An. stephensi stabbilixxa ruħu daqshekk fl-HOA huwa kritiku biex wieħed ibassar it-tixrid potenzjali tiegħu għal żoni ġodda. Il-ġenetika tal-popolazzjoni ntużat b'mod estensiv biex jiġu studjati l-ispeċi vettorjali biex jinkiseb għarfien dwar l-istruttura tal-popolazzjoni, l-għażla kontinwa, u l-fluss tal-ġeni18,19. Għal An. stephensi, l-istudju tal-istruttura tal-popolazzjoni u l-istruttura tal-ġenoma jista' jgħin biex tiġi ċċarata r-rotta ta' invażjoni tiegħu u kwalunkwe evoluzzjoni adattiva li setgħet seħħet minn mindu tfaċċa. Minbarra l-fluss tal-ġeni, l-għażla hija partikolarment importanti għaliex tista' tidentifika alleli assoċjati mar-reżistenza għall-insettiċidi u titfa' dawl fuq kif dawn l-alleli qed jinfirxu fil-popolazzjoni20.
Sal-lum, l-ittestjar tal-markaturi tar-reżistenza għall-insettiċidi u l-ġenetika tal-popolazzjoni fl-ispeċi invażiva Anopheles stephensi kien limitat għal ftit ġeni kandidati. Il-feġġ tal-ispeċi fl-Afrika mhux mifhum għalkollox, iżda ipoteżi waħda hija li ġiet introdotta mill-bnedmin jew mill-bhejjem. Teoriji oħra jinkludu migrazzjoni fuq distanzi twal bir-riħ. L-iżolati Etjopjani użati f'dan l-istudju nġabru f'Awash Sebat Kilo, belt li tinsab 200 km fil-lvant ta' Addis Ababa u fuq il-kuritur ewlieni tat-trasport minn Addis Ababa sa Djibouti. Awash Sebat Kilo hija żona b'trażmissjoni għolja tal-malarja u għandha popolazzjoni kbira ta' Anopheles stephensi, li huwa rrappurtat li huwa reżistenti għall-insettiċidi, u dan jagħmilha sit importanti għall-istudju tal-ġenetika tal-popolazzjoni ta' Anopheles stephensi8.
Il-mutazzjoni tar-reżistenza għall-insettiċidi kdr L1014F ġiet skoperta bi frekwenza baxxa fil-popolazzjoni Etjopjana u ma nstabitx fil-kampjuni tal-għalqa Indjani. Din il-mutazzjoni kdr tagħti reżistenza għall-piretrojdi u d-DDT u kienet diġà skoperta fil-popolazzjonijiet ta' An. stephensi miġbura fl-Indja fl-2016 u fl-Afganistan fl-2018.31,32 Minkejja l-evidenza ta' reżistenza mifruxa għall-piretrojdi fiż-żewġ bliet, il-mutazzjoni kdr L1014F ma nstabitx fil-popolazzjonijiet ta' Mangalore u Bangalore analizzati hawnhekk. Il-proporzjon baxx ta' iżolati Etjopjani li jġorru dan l-SNP li kienu eterożigoti jissuġġerixxi li l-mutazzjoni qamet reċentement f'din il-popolazzjoni. Dan huwa appoġġjat minn studju preċedenti f'Awash li ma sab l-ebda evidenza tal-mutazzjoni kdr f'kampjuni miġbura fis-sena ta' qabel dawk analizzati hawn.18 Aħna qabel identifikajna din il-mutazzjoni kdr L1014F bi frekwenza baxxa f'sett ta' kampjuni mill-istess reġjun/sena bl-użu ta' approċċ ta' skoperta ta' amplikon.28 Minħabba r-reżistenza fenotipika fis-siti tal-kampjunar, il-frekwenza baxxa tal-allele ta' dan il-markatur tar-reżistenza tissuġġerixxi li mekkaniżmi oħra għajr il-modifika tas-sit fil-mira huma responsabbli għal dan il-fenotip osservat.
Limitazzjoni ta' dan l-istudju hija n-nuqqas ta' dejta fenotipika dwar ir-rispons għall-insettiċidi. Huma meħtieġa aktar studji li jikkombinaw is-sekwenzar tal-ġenoma sħiħ (WGS) jew is-sekwenzar tal-amplikon immirat flimkien ma' bijoassaġġi tas-suxxettibilità biex jiġi investigat l-impatt ta' dawn il-mutazzjonijiet fuq ir-rispons għall-insettiċidi. Dawn l-SNPs missense ġodda li jistgħu jkunu assoċjati mar-reżistenza għandhom ikunu mmirati għal assays molekulari b'rendiment għoli biex jappoġġjaw il-monitoraġġ u jiffaċilitaw ix-xogħol funzjonali biex jifhmu u jivvalidaw mekkaniżmi potenzjali assoċjati ma' fenotipi ta' reżistenza.
Fil-qosor, dan l-istudju jipprovdi fehim aktar profond tal-ġenetika tal-popolazzjoni tan-nemus Anopheles fil-kontinenti kollha. L-applikazzjoni tal-analiżi tas-sekwenzjar tal-ġenoma sħiħ (WGS) għal gruppi akbar ta’ kampjuni f’reġjuni ġeografiċi differenti se tkun kruċjali biex jinftiehem il-fluss tal-ġeni u jiġu identifikati markaturi tar-reżistenza għall-insettiċidi. Dan l-għarfien se jippermetti lill-awtoritajiet tas-saħħa pubblika jagħmlu għażliet infurmati fis-sorveljanza tal-vetturi u l-użu tal-insettiċidi.
Użajna żewġ approċċi biex niskopru l-varjazzjoni fin-numru tal-kopji f'dan is-sett tad-dejta. L-ewwel, użajna approċċ ibbażat fuq il-kopertura li ffoka fuq gruppi ta' ġeni CYP identifikati fil-ġenoma (Tabella Supplimentari S5). Il-kopertura tal-kampjun ġiet ikkalkulata bħala medja fil-postijiet tal-ġbir u maqsuma f'erba' gruppi: l-Etjopja, l-għelieqi Indjani, il-kolonji Indjani, u l-kolonji Pakistani. Il-kopertura għal kull grupp ġiet normalizzata bl-użu tat-twittija tal-kernel u mbagħad ipplottjata skont il-fond medjan tal-kopertura tal-ġenoma għal dak il-grupp.
Ħin tal-posta: 23 ta' Ġunju 2025